Slovakia aloittaa EU-puheenjohtajuuskautensa 1.7.2016. Slovakian ulkoministeri Miroslav Lajčák kertoi kesäkuussa European Policy Centerin (EPC) järjestämässä tiedotustilaisuudessa Brysselissä maansa prioriteeteista tulevalle kuuden kuukauden puheenjohtajuuskaudelle. Nykyisen puheenjohtajavaltion Alankomaiden tavoin Slovakian työohjelman yksi prioriteeteista on EU-alueen vahva talous. Muita Slovakian puheenjohtajuuskauden kärkiteemoja ovat sisämarkkinoiden laajentaminen, EU:n turvapaikka- ja maahanmuuttopolitiikan uudistaminen sekä EU:n kauppapolitiikka. Lajčák korosti ESIR-rahaston ja rajat ylittävän rahoituksen merkitystä vahvan talouden luomisessa sekä muistutti, että EU:n budjetin tulisi heijastella unionin prioriteetteja. Sisämarkkinoihin liittyen Lajčák peräänkuulutti erityisesti digitaalisten sisämarkkinoiden kehittämistä sekä nosti esiin tarpeen rakentaa Euroopalle luotettava energiaunioni. Viimeistään käsillä olevan pakolaiskriisin paljastamia EU:n turvapaikka- ja maahanmuuttopolitiikan ongelmia ei voida ratkaista kansallisen tason päätöksillä vaan tarvitaan koko EU:n laajuisia, yhteisiä ratkaisuja. Transatlanttista kauppa- ja investointikumppanuussopimusta (TTIP) Lajčák pitää Euroopalle valtavana mahdollisuutena mutta painotti, että sopimus ei saa alentaa EU:n korkeita standardeja.
Lajčák luetteli puheenvuoronsa alussa pitkän listan Euroopan viime vuosina kohtaamista haasteista – Kreikan kriisi, pakolaiskriisi, terrorismi – mutta nosti suurimmaksi ongelmaksi unionin poliittisen sirpaloitumisen. Ongelmista huolimatta Lajčák näkee EU:n ainoana elinvoimaisena vaihtoehtona Euroopan tulevaisuudelle. Hän korosti kuitenkin, että EU:n ongelmien ratkaisujen tulee olla sellaisia, että kaikki jäsenmaat pystyvät ne hyväksymään. Tiedotustilaisuuden kyselyosuudessa nousi esiin useita ajankohtaisia aiheita kuten Britannian EU-jäsenyyttä koskeva kansanäänestys, EU:n ja Turkin välinen sopimus koskien pakolaiskriisin hallintaa, Ukrainan tilanne, ilmastonmuutoksen torjuminen, EU:n energiapolitiikka ja EU:n laajeneminen. Vastauksissaan ulkoministeri painotti, että Slovakia ei halua olla puheenjohtajavaltiona ainoastaan kriisin hallitsija vaan johtaa neuvostoa ja EU:ta kohti kokonaisvaltaisia ja kestäviä ratkaisuja.